Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBW1

LRRC4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4Q9HBW1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRC4Q9HBW1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC4Q9HBW1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms