Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP29Q9HBJ7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP29Q9HBJ7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms