Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMURF2Q9HAU4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMURF2Q9HAU4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms