Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C10orf88Q9H8K7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
C10orf88Q9H8K7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms