Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMYD3Q9H7B4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SMYD3Q9H7B4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms