Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6E4

CCDC134, Coiled-coil domain-containing protein 134, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC134Q9H6E4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC134Q9H6E4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC134Q9H6E4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms