Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L7

SMARCAD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCAD1Q9H4L7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCAD1Q9H4L7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCAD1Q9H4L7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCAD1Q9H4L7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.5 ms