Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MED28Q9H204 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MED28Q9H204 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MED28Q9H204 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms