Protein–RNA interactions for Protein: Q9H159

CDH19, Cadherin-19, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH19Q9H159 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH19Q9H159 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH19Q9H159 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms