Protein–RNA interactions for Protein: Q9H040

SPRTN, SprT-like domain-containing protein Spartan, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRTNQ9H040 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SPRTNQ9H040 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms