Protein–RNA interactions for Protein: Q9H009

NACA2, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACA2Q9H009 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NACA2Q9H009 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NACA2Q9H009 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NACA2Q9H009 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms