Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BPESC1Q9GZL8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPESC1Q9GZL8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPESC1Q9GZL8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPESC1Q9GZL8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPESC1Q9GZL8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPESC1Q9GZL8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPESC1Q9GZL8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPESC1Q9GZL8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPESC1Q9GZL8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPESC1Q9GZL8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPESC1Q9GZL8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPESC1Q9GZL8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPESC1Q9GZL8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPESC1Q9GZL8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPESC1Q9GZL8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPESC1Q9GZL8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BPESC1Q9GZL8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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