Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL4Q9C0H6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL4Q9C0H6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms