Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LNPKQ9C0E8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LNPKQ9C0E8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LNPKQ9C0E8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LNPKQ9C0E8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LNPKQ9C0E8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LNPKQ9C0E8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LNPKQ9C0E8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LNPKQ9C0E8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LNPKQ9C0E8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LNPKQ9C0E8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LNPKQ9C0E8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LNPKQ9C0E8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LNPKQ9C0E8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LNPKQ9C0E8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LNPKQ9C0E8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LNPKQ9C0E8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LNPKQ9C0E8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LNPKQ9C0E8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LNPKQ9C0E8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LNPKQ9C0E8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LNPKQ9C0E8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LNPKQ9C0E8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LNPKQ9C0E8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LNPKQ9C0E8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LNPKQ9C0E8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LNPKQ9C0E8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LNPKQ9C0E8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LNPKQ9C0E8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LNPKQ9C0E8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LNPKQ9C0E8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LNPKQ9C0E8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LNPKQ9C0E8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LNPKQ9C0E8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LNPKQ9C0E8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LNPKQ9C0E8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LNPKQ9C0E8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LNPKQ9C0E8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LNPKQ9C0E8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LNPKQ9C0E8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LNPKQ9C0E8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LNPKQ9C0E8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
LNPKQ9C0E8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
LNPKQ9C0E8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LNPKQ9C0E8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LNPKQ9C0E8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LNPKQ9C0E8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LNPKQ9C0E8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LNPKQ9C0E8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LNPKQ9C0E8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LNPKQ9C0E8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LNPKQ9C0E8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LNPKQ9C0E8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.2 ms