Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXQ1Q9C009 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXQ1Q9C009 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXQ1Q9C009 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXQ1Q9C009 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXQ1Q9C009 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FOXQ1Q9C009 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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