Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM54Q9BYV2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM54Q9BYV2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms