Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD6

MRPL1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL1Q9BYD6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL1Q9BYD6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MRPL1Q9BYD6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MRPL1Q9BYD6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MRPL1Q9BYD6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL1Q9BYD6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL1Q9BYD6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL1Q9BYD6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL1Q9BYD6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL1Q9BYD6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL1Q9BYD6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL1Q9BYD6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL1Q9BYD6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL1Q9BYD6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL1Q9BYD6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL1Q9BYD6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL1Q9BYD6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL1Q9BYD6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRPL1Q9BYD6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRPL1Q9BYD6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRPL1Q9BYD6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRPL1Q9BYD6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRPL1Q9BYD6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms