Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD3

MRPL4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL4Q9BYD3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MRPL4Q9BYD3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL4Q9BYD3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL4Q9BYD3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms