Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MAP1LC3CQ9BXW4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms