Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VN1R3Q9BXE9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VN1R3Q9BXE9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms