Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH2

FUNDC2, FUN14 domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUNDC2Q9BWH2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FUNDC2Q9BWH2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FUNDC2Q9BWH2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FUNDC2Q9BWH2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FUNDC2Q9BWH2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FUNDC2Q9BWH2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FUNDC2Q9BWH2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FUNDC2Q9BWH2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FUNDC2Q9BWH2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FUNDC2Q9BWH2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FUNDC2Q9BWH2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FUNDC2Q9BWH2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FUNDC2Q9BWH2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FUNDC2Q9BWH2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FUNDC2Q9BWH2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FUNDC2Q9BWH2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms