Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM2Q9BVW6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms