Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PBDC1Q9BVG4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PBDC1Q9BVG4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms