Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG3

TRIM62, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM62, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM62Q9BVG3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM62Q9BVG3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM62Q9BVG3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms