Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC6

TMEM109, Transmembrane protein 109, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM109Q9BVC6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM109Q9BVC6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM109Q9BVC6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM109Q9BVC6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM109Q9BVC6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM109Q9BVC6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM109Q9BVC6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM109Q9BVC6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM109Q9BVC6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM109Q9BVC6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM109Q9BVC6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM109Q9BVC6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM109Q9BVC6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM109Q9BVC6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM109Q9BVC6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM109Q9BVC6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms