Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf50Q9BV19 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
C1orf50Q9BV19 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf50Q9BV19 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms