Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUB5

MKNK1, MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK1Q9BUB5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKNK1Q9BUB5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MKNK1Q9BUB5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MKNK1Q9BUB5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MKNK1Q9BUB5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MKNK1Q9BUB5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MKNK1Q9BUB5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MKNK1Q9BUB5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKNK1Q9BUB5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms