Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDFIP1Q9BT67 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NDFIP1Q9BT67 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms