Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYT17Q9BSW7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYT17Q9BSW7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYT17Q9BSW7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYT17Q9BSW7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYT17Q9BSW7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYT17Q9BSW7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYT17Q9BSW7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYT17Q9BSW7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYT17Q9BSW7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYT17Q9BSW7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SYT17Q9BSW7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SYT17Q9BSW7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYT17Q9BSW7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYT17Q9BSW7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYT17Q9BSW7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYT17Q9BSW7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYT17Q9BSW7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYT17Q9BSW7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYT17Q9BSW7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYT17Q9BSW7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYT17Q9BSW7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYT17Q9BSW7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYT17Q9BSW7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYT17Q9BSW7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SYT17Q9BSW7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYT17Q9BSW7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYT17Q9BSW7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYT17Q9BSW7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYT17Q9BSW7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYT17Q9BSW7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SYT17Q9BSW7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYT17Q9BSW7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYT17Q9BSW7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYT17Q9BSW7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SYT17Q9BSW7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SYT17Q9BSW7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYT17Q9BSW7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYT17Q9BSW7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYT17Q9BSW7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYT17Q9BSW7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYT17Q9BSW7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYT17Q9BSW7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYT17Q9BSW7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYT17Q9BSW7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYT17Q9BSW7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYT17Q9BSW7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYT17Q9BSW7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYT17Q9BSW7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYT17Q9BSW7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYT17Q9BSW7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYT17Q9BSW7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYT17Q9BSW7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SYT17Q9BSW7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYT17Q9BSW7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYT17Q9BSW7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYT17Q9BSW7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYT17Q9BSW7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYT17Q9BSW7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYT17Q9BSW7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SYT17Q9BSW7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SYT17Q9BSW7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYT17Q9BSW7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYT17Q9BSW7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYT17Q9BSW7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYT17Q9BSW7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SYT17Q9BSW7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYT17Q9BSW7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYT17Q9BSW7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYT17Q9BSW7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYT17Q9BSW7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYT17Q9BSW7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYT17Q9BSW7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYT17Q9BSW7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYT17Q9BSW7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYT17Q9BSW7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYT17Q9BSW7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYT17Q9BSW7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYT17Q9BSW7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYT17Q9BSW7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYT17Q9BSW7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYT17Q9BSW7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYT17Q9BSW7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYT17Q9BSW7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYT17Q9BSW7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYT17Q9BSW7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SYT17Q9BSW7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYT17Q9BSW7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYT17Q9BSW7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYT17Q9BSW7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYT17Q9BSW7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYT17Q9BSW7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SYT17Q9BSW7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SYT17Q9BSW7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYT17Q9BSW7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SYT17Q9BSW7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYT17Q9BSW7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYT17Q9BSW7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYT17Q9BSW7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYT17Q9BSW7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms