Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TXNDC17Q9BRA2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms