Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NPAS2Q99743 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPAS2Q99743 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPAS2Q99743 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPAS2Q99743 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPAS2Q99743 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPAS2Q99743 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPAS2Q99743 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPAS2Q99743 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPAS2Q99743 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPAS2Q99743 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NPAS2Q99743 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPAS2Q99743 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPAS2Q99743 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPAS2Q99743 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPAS2Q99743 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPAS2Q99743 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPAS2Q99743 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPAS2Q99743 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPAS2Q99743 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPAS2Q99743 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPAS2Q99743 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPAS2Q99743 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPAS2Q99743 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPAS2Q99743 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPAS2Q99743 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPAS2Q99743 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPAS2Q99743 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPAS2Q99743 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPAS2Q99743 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPAS2Q99743 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPAS2Q99743 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPAS2Q99743 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms