Protein–RNA interactions for Protein: Q99614

TTC1, Tetratricopeptide repeat protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC1Q99614 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TTC1Q99614 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC1Q99614 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms