Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGMNQ99538 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LGMNQ99538 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGMNQ99538 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms