Protein–RNA interactions for Protein: Q96SK2

TMEM209, Transmembrane protein 209, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM209Q96SK2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
TMEM209Q96SK2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM209Q96SK2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM209Q96SK2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms