Protein–RNA interactions for Protein: Q96QU6

ACCS, 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACCSQ96QU6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ACCSQ96QU6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACCSQ96QU6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms