Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMG1Q96Q15 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMG1Q96Q15 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms