Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN8

TSSK3, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK3Q96PN8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSSK3Q96PN8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSSK3Q96PN8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TSSK3Q96PN8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TSSK3Q96PN8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TSSK3Q96PN8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSSK3Q96PN8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSSK3Q96PN8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSSK3Q96PN8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSSK3Q96PN8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSSK3Q96PN8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSSK3Q96PN8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSSK3Q96PN8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSSK3Q96PN8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSSK3Q96PN8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSSK3Q96PN8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSSK3Q96PN8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSSK3Q96PN8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSSK3Q96PN8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSSK3Q96PN8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSSK3Q96PN8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.8 ms