Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL3

ZNF599, Zinc finger protein 599, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF599Q96NL3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF599Q96NL3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF599Q96NL3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF599Q96NL3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF599Q96NL3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF599Q96NL3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF599Q96NL3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF599Q96NL3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF599Q96NL3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF599Q96NL3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF599Q96NL3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF599Q96NL3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF599Q96NL3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF599Q96NL3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF599Q96NL3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF599Q96NL3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF599Q96NL3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF599Q96NL3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF599Q96NL3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF599Q96NL3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF599Q96NL3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF599Q96NL3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF599Q96NL3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF599Q96NL3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF599Q96NL3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF599Q96NL3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF599Q96NL3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF599Q96NL3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF599Q96NL3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF599Q96NL3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF599Q96NL3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms