Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF396Q96N95 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
ZNF396Q96N95 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ZNF396Q96N95 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF396Q96N95 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF396Q96N95 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF396Q96N95 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF396Q96N95 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF396Q96N95 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF396Q96N95 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF396Q96N95 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF396Q96N95 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF396Q96N95 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF396Q96N95 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF396Q96N95 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF396Q96N95 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF396Q96N95 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF396Q96N95 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF396Q96N95 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF396Q96N95 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF396Q96N95 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF396Q96N95 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF396Q96N95 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF396Q96N95 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF396Q96N95 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF396Q96N95 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF396Q96N95 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF396Q96N95 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF396Q96N95 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF396Q96N95 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF396Q96N95 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF396Q96N95 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF396Q96N95 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF396Q96N95 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF396Q96N95 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms