Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG7

NSMCE3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE3Q96MG7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NSMCE3Q96MG7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms