Protein–RNA interactions for Protein: Q96LZ7

RMDN2, Regulator of microtubule dynamics protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN2Q96LZ7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RMDN2Q96LZ7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RMDN2Q96LZ7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RMDN2Q96LZ7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RMDN2Q96LZ7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RMDN2Q96LZ7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RMDN2Q96LZ7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RMDN2Q96LZ7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RMDN2Q96LZ7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RMDN2Q96LZ7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RMDN2Q96LZ7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RMDN2Q96LZ7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RMDN2Q96LZ7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RMDN2Q96LZ7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RMDN2Q96LZ7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RMDN2Q96LZ7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RMDN2Q96LZ7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RMDN2Q96LZ7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RMDN2Q96LZ7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms