Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC17Q96LX7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC17Q96LX7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC17Q96LX7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC17Q96LX7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC17Q96LX7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC17Q96LX7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC17Q96LX7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC17Q96LX7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC17Q96LX7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC17Q96LX7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC17Q96LX7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC17Q96LX7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC17Q96LX7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC17Q96LX7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC17Q96LX7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC17Q96LX7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC17Q96LX7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC17Q96LX7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC17Q96LX7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC17Q96LX7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC17Q96LX7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC17Q96LX7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC17Q96LX7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC17Q96LX7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC17Q96LX7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC17Q96LX7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms