Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf72Q96LT7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf72Q96LT7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms