Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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C2orf48Q96LS8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C2orf48Q96LS8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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