Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB3

IFT74, Intraflagellar transport protein 74 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT74Q96LB3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT74Q96LB3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFT74Q96LB3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms