Protein–RNA interactions for Protein: Q96L33

RHOV, Rho-related GTP-binding protein RhoV, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOVQ96L33 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOVQ96L33 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RHOVQ96L33 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOVQ96L33 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOVQ96L33 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOVQ96L33 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOVQ96L33 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOVQ96L33 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOVQ96L33 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOVQ96L33 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOVQ96L33 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOVQ96L33 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOVQ96L33 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOVQ96L33 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOVQ96L33 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOVQ96L33 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOVQ96L33 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOVQ96L33 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOVQ96L33 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOVQ96L33 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOVQ96L33 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOVQ96L33 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOVQ96L33 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOVQ96L33 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHOVQ96L33 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOVQ96L33 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOVQ96L33 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOVQ96L33 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOVQ96L33 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOVQ96L33 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOVQ96L33 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOVQ96L33 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOVQ96L33 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOVQ96L33 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOVQ96L33 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOVQ96L33 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOVQ96L33 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOVQ96L33 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOVQ96L33 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHOVQ96L33 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms