Protein–RNA interactions for Protein: Q96K49

TMEM87B, Transmembrane protein 87B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87BQ96K49 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMEM87BQ96K49 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM87BQ96K49 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM87BQ96K49 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms