Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NEURL4Q96JN8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NEURL4Q96JN8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NEURL4Q96JN8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
NEURL4Q96JN8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NEURL4Q96JN8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
NEURL4Q96JN8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NEURL4Q96JN8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NEURL4Q96JN8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NEURL4Q96JN8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NEURL4Q96JN8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NEURL4Q96JN8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NEURL4Q96JN8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NEURL4Q96JN8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NEURL4Q96JN8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NEURL4Q96JN8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NEURL4Q96JN8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NEURL4Q96JN8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NEURL4Q96JN8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NEURL4Q96JN8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NEURL4Q96JN8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NEURL4Q96JN8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NEURL4Q96JN8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NEURL4Q96JN8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NEURL4Q96JN8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NEURL4Q96JN8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NEURL4Q96JN8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NEURL4Q96JN8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NEURL4Q96JN8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NEURL4Q96JN8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
NEURL4Q96JN8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NEURL4Q96JN8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NEURL4Q96JN8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NEURL4Q96JN8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NEURL4Q96JN8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NEURL4Q96JN8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NEURL4Q96JN8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NEURL4Q96JN8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NEURL4Q96JN8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NEURL4Q96JN8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NEURL4Q96JN8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
NEURL4Q96JN8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NEURL4Q96JN8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NEURL4Q96JN8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NEURL4Q96JN8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
NEURL4Q96JN8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NEURL4Q96JN8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms