Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCMH1Q96GD3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCMH1Q96GD3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms