Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ7

CHMP6, Charged multivesicular body protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP6Q96FZ7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHMP6Q96FZ7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP6Q96FZ7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms